1.必需氨基酸和微量元素学说
必需氨基酸和微量元素学说为传统药理学说。该学说认为，阿胶的许多药理作用与其所含的氨基酸和微量元素有关。但必需氨基酸理论不能解释为何阿胶的补血、补益作用优于其它含18种类似氨基酸的生物制剂；微量元素尽管与改善营养缺乏性贫血有关，但一般仅与体内多种酶活性有关况且微量元素过多吸收尚有可能导致中毒。因此，用此学说难以解释阿胶广泛的药理作用。此外，还有学者认为其部分药理作用与所含硫酸皮肤素有关，但这些学说均只是从所含成分的角度去考虑。
2.“聚负离子基”结构学说
该学说认为，阿胶的药效与其特有的聚负离子基结构有关。阿胶中的多种成分有较多的负电荷，电泳时偏向阳极，均可形成聚负离子基结构。负离子基是指生物大分子中含有的羧基、硫酸酯基、硫酸基、磷酰基等基团。在阿胶的有效成分中，中性氨基酸和酸性氨基酸含量较高，因而具备聚负离子基结构形成的物质基础。在阿胶制备过程中，疏水性的胶原蛋白通过温度、水分的作用而变成亲水性胶体，之后形成独特的聚负离子基结构。
现代生物化学研究发现，含有负离子基结构的物质所具有的共性为：由于较多的负离子基存在，负电荷相互排斥，使得溶液中每个分子占据较大的空间，形成稳定的大分子晶体结构，使其无需进入细胞内部，仅通过细胞外间质的代谢来调节细胞功能，改善细胞微环境，参与生理与病理过程。研究发现，人体细胞含有负离子基载体，有机阴离子转移多肽存在于哺乳动物肝、肾等细胞膜上，对具有负离子基结构的激素、药物进行吸收，以调整细胞功能。这一发现，除了可以支持本学说外，亦可进一步支持某些中医相关理论。其它有关负离子研究结论与阿胶的研究结论具有相同之处。
由于阿胶具有良好的药效作用，临床应用广泛，为了探讨其药理作用及作用机制，今年来众多医药工作者做了大量卓有成效的研究工作，取得了显著效果。基本明确了其补益、止血等作用机理，但对于其与改善相关的具体有效成分、作用靶点，以及在体内的吸收、分布与排泄等情况，还有待广大医药工作者继续努力，不断探索，以进一步明确阿胶的各项药理作用机制，为临床用药提供更有力的依据。
