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低聚果糖进入人体后不能被唾液和消化酶分解，直接通过胃和小肠到达结肠，被结肠内的有益菌主要是双歧杆菌所利用，使双歧杆菌得到大量繁殖，同时产生有机酸如醋酸、丙酸、丁酸和乳酸等。抑制肠内腐败菌的生长，减少腐败产物生成，从而起到防止便秘、降低血脂和胆固醇、促进矿物质的吸收和肠内有毒废物的排除、提高免疫力等一系列作用。而且其本身由于极难被人体吸收，故属于低热量难消化、低龋齿性的可溶性膳食纤维。
低聚果糖的食用安全性在许多国家已得到政府的确认，1992年日本厚生省批准低聚果糖为特定保健品，年产量达4万吨，应用范围多达200余种食品；2000年，美国食品和药物管理局经审核，认可低聚果糖作为公认安全级（GRAS）功能食品配料，并将结果给予公告。在欧洲，低聚果糖被作为控制胆固醇水平的功能性甜味剂而广泛应用于食品产品中。在台湾，含低聚果糖的甜食、糕点、软饮料和饼干等在保健品市场很受欢迎。在中国，低聚果糖已明确作为润肠通便、调理肠道菌群的普通食品。
低聚果糖又称蔗果低聚糖，是由1～3个果糖基通过β（2—1）糖苷键与蔗糖中的果糖基结合生成的蔗果三糖、蔗果四糖和蔗果五糖等的混合物。100克干重菊芋中约有60—70克菊粉，菊粉是通过线性的β—2，1—糖苷链连接的果聚糖，其末端为一蔗糖基。故以菊芋粉为原料用菊糖内切酶水解作用，经精制最终可得低聚果糖浆。
养生功效
低聚果糖除具有一般功能性低聚糖的物理化学性质外，最引人注目的生理特性是它能明显改善肠道内微生物种群比例，它是肠内双歧杆菌的活化增殖因子，可减少和抑制肠内fubai物质的产生，抑制有害细菌的生长，调节肠道内平衡；能促进微量元素铁、钙的吸收与利用，以防止骨质疏松症；可减少肝脏毒素，能在肠中生成抗癌的有机酸，有显著的防癌功能；且口味纯正香甜可口，具有类似脂肪的香味和爽口的滑腻感。近几年低聚果糖的产品风靡日、欧、美等保健品市场。
糖浆为无色或淡huangse、透明粘稠液体，带低聚果糖清香，甜味柔和清爽，无异味，无外来杂质。
糖粉为白色或微huangse无定型粉末（颗粒为白色或微huangse无定型颗粒），甜味柔和清爽，带低聚果糖清香，无异味，无外来杂质。
低聚果糖的六大功效：
1. 低热能值，由于低聚果糖不能被renti直接消化吸收，只能被肠道细菌吸收利用，故其热值低，不会导致肥胖，间接也有减肥作用。对糖尿病患者来说也是一种良好的甜味剂。
2. 由于其不能被口腔细菌（指突变链球菌Smutans）利用，因而具有防龋齿作用。
3. 对肠道益菌的增殖作用。低聚果糖对肠道中有益菌群如双岐杆菌、乳酸杆菌等有选择性增殖作用，使有益菌群在肠道中占有优势，抑制有害菌的生长，减少有毒物质（如内毒素、氨类等）的形成，对肠粘膜细胞和肝具有保护作用，从而防止病变肠癌的发生，增强机体免疫力。
4. 可降低血清中胆固醇和甘油三酯的含量。
5. 促进营养的吸收，尤其是钙的吸收。摄入低聚果糖能提高生物体对钙离子的吸收，这一现象受到了越来越多的关注，一些renti临床实验也得以陆续开展。对于青少年，含有丰富低聚果糖的菊粉证实可通过强化钙质吸收和增加骨密度对骨骼健康产生正面的效用。对于停经后的妇女，富含低聚果糖的菊粉证实可提高矿物质吸收而改善骨骼健康。另有临床研究结果指出，补充含有丰富低聚果糖的菊粉可帮助改善更年期妇女的矿物质吸收并影响其骨更新标记。
6. 防治腹泻和便秘。
