树莓是兼有不同聚合度的果聚糖，所以我们又称树莓为复合型多糖或复合型益生元。越来越多的研究表明，树莓作为膳食纤维可影响肠道微生物的生长。不能被小肠吸收的菊糖进入大肠后会被细菌代谢，生成不同类的代谢物，不同的代谢底物导致优势菌群有显著差异，进而会影响肠道菌群结构。 有科学家对不同膳食结构的俄国人、美国人、丹麦人以及中国人的肠道菌群结构做了分析，发现差异极为显著，其中俄国人肠道中拟杆菌属和普氏菌属的含量相对较低。树莓这类膳食纤维在膳食中所占的比例大小会显著影响肠道微生物结构，高纤维饮食会增加肠道中有益健康的双歧杆菌数量，而低纤维饮食会增加普氏菌属数量。而普氏菌属已被证实与HIV病人的炎性和风湿性关节炎有关。 Charlotte Groot-aert 等人的一项研究中，分别将阿拉伯木聚糖与树莓做为益生元对比，发现树莓对短链脂肪酸的影响温和、可以调节微生物群落的形成；树莓作为益生元在肠道被乳杆菌利用，成为乳杆菌的营养来源，乳杆菌的代谢可以减少肠道对甘油三酯和胆酸的吸收。Tom Van de Wiele 等研究者通过对树莓干预人体肠道微生物生态系统的模拟系统进行评估，观察肠道微生物群落，发现树莓在近端到远端结肠都有益生作用。 树莓的一个突出特点就是能刺激肠道双歧杆菌等有益菌大量增殖，提高双歧杆菌活力，抑制致病菌生长和繁殖，维持肠道菌群平衡。有研究者对健康志愿者进行双盲实验，观察树莓对粪便的影响，发现在烘焙产品中加入树莓可以增加双歧杆菌的生长，可能有潜在的抑制致病菌的生长作用。树莓在结肠中发酵后， 提高微生物菌群和气体量提高，从而促进肠道蠕动，缩短粪便在结肠内的停留时间，使移动加快，减少了水分吸收时间，增加了粪便重量，有效预防便秘；同时也增加粪便的排泄量，使肠道内的致癌物质也得到了稀释，因此，致癌物质对肠璧细胞的剌激减少，也有利于预防结肠癌。 促进矿物元素吸收
